La oficina regional de DNDi en América Latina está localizada en Río de Janeiro, donde funciona desde 2004. Con un equipo local permanente y distintos consultores, el principal objetivo de la oficina es apoyar, planear y gestionar actividades regionales de I+D de medicamentos para la enfermedad de Chagas, la malaria y la leishmaniosis visceral.

Para ello, investiga las condiciones y necesidades de los pacientes, establece asociaciones de colaboración, implementa proyectos y promueve el entrenamiento y la capacitación en recursos humanos, llevando en consideración la importancia de orientar la I+D hacia herramientas de salud que se adapten y sean relevantes para su uso en campo, en el contexto de América Latina.

Asimismo, el escritorio participa en diferentes congresos científicos, contribuye con publicaciones en el área de las enfermedades olvidadas, realiza la producción de películas y documentales, así como una serie de otras actividades de comunicación y promoción destinados a promover la toma de conciencia con respecto a las enfermedades olvidadas, señalando las necesidad de un mayor liderazgo político y estímulo a la I+D que garantice el acceso a los medicamentos esenciales.

El trabajo conducido a nivel regional es fundamental para ofrecer soluciones innovadoras a los desafíos que DNDi encuentra en el desarrollo de medicamentos. Un importante ejemplo es el ASMQ, una combinación de dosis fija para el tratamiento de la malaria falciparum no complicada, indicada para su uso en América Latina y el Sudeste Asiático, cuyo desarrollo farmacéutico y producción industrial fueron realizados por el laboratorio público brasileño Farmanguinhos.

Tras su lanzamiento en abril de 2008, DNDi está trabajando actualmente con Farmanguinhos en la transferencia de tecnología del ASMQ a Cipla, en la India. Además, el trabajo de la oficina regional tuvo un papel fundamental en la identificación de aquellos países de América Latina que podrían beneficiarse con la utilización de esta innovadora combinación de dosis fija para el tratamiento de la malaria, tales como Perú, Bolivia, Venezuela y Colombia. DNDi ya está estudiando las estrategias para el registro del ASMQ en la región.