DNDi ha creado una cartera centrada en la THA, la leishmaniosis, y la enfermedad de Chagas que cumple el principal objetivo de I+D que es poner a disposición de los pacientes entre seis y ocho nuevos tratamientos hasta el año 2014.

ASAQ – Combinación de dosis fijas (CDF) de artesunato y amodiaquina para el tratamiento de la malaria en África subsahariana; terapia lanzada en marzo de 2007 y registrada en 24 países que padecen enfermedades endémicas; es producida por sanofi-aventisen en una colaboración pionera con DNDi; obtuvo la precalificación de la OMS en octubre de 2008; se distribuyeron 5 millones de tratamientos en 2008, y se espera distribuir más de 20 millones en 2009.

ASMQ – CDF de artesunato y mefloquina para el tratamiento de la malaria en América Latina y Asia; fue registrada en Brasil, en marzo de 2008, en colaboración con Farmanguinhos / Fiocruz; la transferencia de tecnología Sur-Sur para Cipla está en marcha a fin de facilitar su puesta a disposición en Asia y África; está siendo empleada actualmente por las autoridades nacionales brasileñas.

NECT – Ensayo clínico para la terapia de coadministración de nifurtimox-eflornitina – los estudios finalizaron con resultados prometedores y fueron presentados en el encuentro anual de la sociedad norteamericana de medicina tropical e higiene (ASTMH, por su sigla en inglés), en diciembre de 2008; el dossier completo fue sometido a aprobación para su inclusión en la Lista de Medicamentos Esenciales (LME) de la OMS en 2008; se incorporó a dicha lista en 2009.

Fexinidazol – primer compuesto de éxito dentro del proyecto nitroimidazoles de DNDi; ya se concluyeron los estudios pre-clínicos; se inició el desarrollo clínico en 2009 y es el único nuevo candidato clínico que se encuentra actualmente en el pipeline para la THA. En mayo de 2009, Sanofi-aventis y DNDi firmaron un acuerdo para desarrollar este compuesto y ponerlo a disposición.

Asociación para la optimización de nuevos compuestos líderes – dos series de compuestos líderes, que salieron de la etapa de screening inicial, progresaron hacia colaboraciones innovadoras con socios norteamericanos: Scynexis e Pace University.

VL Estudios sobre medicamentos combinados para la LV en África, Asia y América Latina – fueron implementados para la evaluación de terapias combinadas seguras y de corta duración. Se utilizaron medicamentos ya existentes registrados en la región con el fin de combatir la resistencia del parásito y brindar tratamientos de menor duración y más eficaces;

• Ensayo de fase III (AmBisome, miltefosina, paromomicina) concebido para la India, Bangladesh y Nepal; reclutamiento de pacientes iniciado en junio de 2008 en dos centros de estudios en Bihar, en la India.
• Ensayo con paromomicina en África – se incluyó a más de 1.000 pacientes en un ensayo multicéntrico en África del Este con el objeto de registrar la paromomicina y evaluar la combinación de corta duración de PM+SSG.
• AmBisome en África - El reclutamiento ha comenzado en 2009 y tiene por objeto comprobar el uso potencial del medicamento en teapias combinadas así como también ampliar su área geográfica de utilización.

Asociación para la optimización de compuestos líderes – Asociación constituida en 2007 con dos colaboradores clave en la India: Advinus e Instituto Central de Investigaciones de Medicamentos (CDRI, por su sigla en inglés); se identificaron dos series de compuestos prometedores en 2008.

Benznidazol pediátrico – acuerdo establecido con LAFEPE para desarrollar la primera formulación de benznidazol para niños a fin de ponerla a disposición y de hacerla accesible como un bien público en 2010.

Asociación para la optimización de compuestos líderes – el proyecto se inició en 2008 con el objeto de desarrollar moléculas a partir de la etapa preliminar del screening exploratorio; Socios: Centro para la Optimización de Candidatos a Medicamentos (CDCO, por sus siglas en inglés), Epichem, la Universidad de Murdoch en Australia, y la Universidad Federal de Ouro Preto en Brasil.

Consolidación de la cartera centrándose en la colección de compuestos, la identificación y validación de objetivos, el desarrollo de ensayos y el screening de alto desempeño (HTS, por su sigla en inglés), así como la identificación de compuestos prometedores y la selección de compuestos líderes. Para la tripanosomiasis humana africana, el HTS es realizado por Eskitis y Scynexis y para la leishmaniasis visceral por el Instituto Pasteur, en Corea; para la enfermedad de Chagas se encuentra en fase de desarrollo. DNDi mantiene asociaciones con la Universidad de Dundee, la Escuela de Medicina Tropical e Higiene de Londres (LSHTM, por su sigla en inglés) y la Universidad da Antuerpia además de desarrollar un trabajo de sinergia con Medicines for Malaria Venture (MMV), Alianza Global para el Desarrollo de Medicamentos para la Tuberculosis (GATB), y el Consorcio para el Desarrollo de Medicamentos contra Parásitos (CPDD, por su sigla en inglés). DNDi también estableció relaciones de colaboración con GSK, sanofi-aventis, Merck, Novartis, Pfizer y Eisai, entre otras.

Existen tres redes regionales para el fortalecimiento de las capacidades de investigación:
En África:Plataforma para la THA y en África del Este (LEAP) plataforma para la leishmaniosis: BPC, conducta ética y capacitación sobre el monitoreo de ensayos clínicos; constitución y capacitación de un Consejo de Vigilancia de Datos e Inocuidad (DSMB, por sus siglas en inglés); talleres sobre metodología de ensayos clínicos e intercambio de información sobre desarrollos recientes en investigación clínica.

En Ásia: la Red Panasiática para Enfermedades Olvidadas (PAN4ND): fortalecimiento de las capacidades de screening en la región asiática con el objeto de purificar e identificar compuestos químicos provenientes de plantas, del suelo y de organismos marítimos.