A DNDi trabalha para desenvolver uma consciência relacionada às doenças negligenciadas, tanto nos países desenvolvidos como naqueles com doenças endêmicas, de forma a aumentar e sustentar o apoio para conseguir um maior compromisso público. A liderança política é fundamental para obter apoio financeiro, para definir prioridades e criar um âmbito mais favorável que estimule a P&D na área da saúde e garanta o acesso equitativo às novas ferramentas de saúde.

A estratégia para a captação de recursos da DNDi deve respeitar e apoiar a estratégia de P&D. As doações devem ser procuradas em concordância com esta estratégia de P&D e com a visão e a missão da DNDi.

A independência da DNDi continua sendo a pedra angular de sua estratégia. Portanto, todo o possível está sendo realizado para criar um conjunto de recursos proveniente de diversas fontes para que nenhum doador efetue contribuições maiores do que 25% de seus lucros anuais e como uma tentativa de diminuir as doações com destinos específicos.

Com a finalidade de permitir uma maior flexibilidade em relação à tomada de decisões necessária para a estratégia e gestão do portfólio de P&D, e a fim de contar com uma maior independência em suas operações, a prioridade da DNDi consiste em aumentar os financiamentos sem restrições à diferença daqueles destinados a projetos específicos. Nos casos em que isto não seja possível, a DNDi buscará recursos para projetos específicos ou com destinos específicos que não tenham requisitos que possam interferir nos objetivos do projeto.